حصل الدكتور نايف نهار الشمري على درجة البكالوريوس في الدراسات الإسلامية من جامعة قطر، ثم نال درجة الماجستير في الفقه وأصوله من الجامعة الإسلامية العالمية في ماليزيا، وحصل من الجامعة نفسها على درجة الدكتوراه في الموضوع ذاته. كما نال الدكتور نايف درجة دكتوراه ثانية في العلوم السياسية من الجامعة الإسلامية العالمية بماليزيا عام 2018.